In de periode 2012 – 2014 is de Nieuwe Badkapel in drie fasen gerestaureerd. In de eerste fase is er gewerkt aan de torens, het dak, het voegwerk van de muren en de twee grote rondboogvensters in de zijmuren. In de tweede fase is de laagbouw, lager dan 8-12 meter, gerestaureerd. Hieronder vallen bijvoorbeeld de daken van de drie galerijen met arcaden, vensters in het trappenhuis en dakranden. In de laatste fase van de restauratie; zijn de karakteristieke ingangsarcade met de zuiltjes gerestaureerd. Er is een nieuwe betonvloer met nieuw terrazo en alle 16 zuiltjes van de galerij zijn vervangen.
Daarnaast zijn in dit laatste stadium voorzieningen getroffen voor de aanlichting van het kerkgebouw.
Middels LED-verlichting worden de twee torens, het rondboogvenster aan de voorzijde en de arcade mooi verlicht. De Nieuwe Badkapel is nu ook ’s avonds een markant baken op de hoek van de Nieuwe Parklaan en de Nieuwe Duinweg.